Οι ασθενειες των φυτων ξεχωριζουν σε 3 μεγαλες κατηγοριες.μολυνσεις απο βακτηριδια ,μηκυτες και ιους.Παροτι οι μηκυτες ειναι πολυ περισσοτεροι την μεγαλυτερη ζημια την κανουν τα βακτηρια και οι ιοι.οι μηκυτες επειδη συγκεντρωνονται στην εξωτερικη επιφανεια του σπορου ειναι πιο ευκολο με την απολυμανση του σπορου να μειωσουμε την ποσοτητα τους.Η πιθανοτητα να εισελθουν στο ενδοσπερμιο του σπορου ειναι υπαρκτη αλλα μικρη. Τα βακτηρια και οι ιοι προκαλουν την λεγομενη συστημικη μολυνση γιατι εισερχονται στο κυκλοφοριακο του φυτου και οταν δημιουργηθει ο καρπος συνηθως υπαρχει στο ενδοσπερμιο του σπορου. Π.χ ειναι σχεδον αδυνατο να εξαλειψουν την Μαυρη σηψη των σταυρανθων η τον ιο του μωσαικου της ντοματας η των κολοκυνθοειδων.Θελει μεγαλη προσοχη απο που προμηθευομαστε τον σπορο. εχει αποδειχθει οτι 1 στους 30000 σπορους σταυρανθων ειναι μολυσμενος με το βακτηριο της μαυρης σηψης.
